根系分析儀也叫分析系統(tǒng)，可以自動測量各直徑段長度、投影面積、表面積、體積等，及其分布參數(shù)。按成像方式不同，可分為對原位根系圖像的分析儀，以及對洗根后的根系圖像分析儀。一般都要求可分析根系的長度、直徑、面積、體積、根尖數(shù)、分叉數(shù)、根交叉數(shù)等。根系分析系統(tǒng)還可分析植物根系的主側(cè)根拓撲形態(tài)關(guān)系、連接關(guān)系，以及根尖部位的色彩變化，以便進行根系形態(tài)和構(gòu)造研究。

　　儀器是基于圖像識別技術(shù)的植物根系圖像監(jiān)測分析系統(tǒng)，用于植物離體洗根后的根系分析，可以分析根系長度、直徑、表面積、體積、根尖數(shù)、分叉數(shù)等，廣泛適用于根系形態(tài)學(xué)及構(gòu)造研究，可用于解決根系結(jié)構(gòu)和幾何參數(shù)難以獲取的問題，提升從業(yè)人員工作效率、減少人工成本，提供根系多參數(shù)快速分析方法，服務(wù)于植物科學(xué)研究。

　　根系分析儀利用高質(zhì)量圖形掃描儀獲取高分辨率植物根系彩色圖像或黑白圖像，該掃描儀在掃描面板下方和上蓋中安裝有專門的雙光源照明系統(tǒng)，并且在掃面板上預(yù)留了雙光源校準區(qū)域。此外，還配備有不同尺寸的、高透明度根系放置盤。掃描時，掃面板下的光源和上蓋板中的光源同時掃過高透明度根盤中的根系樣品，這樣可以避免根系掃描時容易產(chǎn)生的陰影和不均勻等現(xiàn)象的影響，有效地保證了獲取的圖像質(zhì)量。

　　儀器采用非統(tǒng)計學(xué)方法測量計算出交叉重疊分根系長度、直徑、面積、體積、根尖等基本的形態(tài)學(xué)參數(shù)；利用軟件的色彩等級分析功能，還可以對根系顏色進行分析，從而進行根系存活數(shù)量、根系生長和營養(yǎng)狀況等方面研究；利用軟件的高級分析功能，還可以對完整的植物根系圖像進行根系連接分析（研究根系分支角度、連通性等形態(tài)特征）、根系拓撲分析（研究根系連接數(shù)量、路徑長度）和根系分級伸展分析（記錄根系整體等級分布情況）。從而滿足研究者針對植物根系不同類別和層次的研究。